스타크래프트 역시 다른 많은 소프트웨어와 마찬가지로 다수의 이스터 에그가 존재한다. 대표적인 것으로 다음이 있다.
- 오리지널 테란 연습 시나리오에서 브리핑이 끝나도 게임을 시작하지 않으면 오퍼레이터가 빨리 가라고 재촉을 한다. 그래도 게임을 시작하지 않으면 갑자기 중국 음식 요리법이 나온다.
- 유닛을 수회 클릭하면 코믹한 대사가 나오는데, 대표적으로 SCV의 "나 폐쇄 공포증 있어, 여기서 나갈래!"와 캐리어의 "당신은 독불장군식이오. 명령을 내리지 않으면 해임될 것이오. 이것은 단순한 협박이 아니오!", 아비터의 "지금 자네의 첫 번째 수업이군. 하하하. 쿠쿠쿠... 시간여행[25]을 원하오?", 커세어의 "이 버튼 어디 쓰는 거지? (꾹) (지지직)[26] 이런, 큰 실수 했다." 등이 있다. 옵저버를 계속 클릭할 경우, 옵저버가 탐지한 테란의 라디오 방송이 나온다. 또, 테란의 시즈 탱크를 수차례 클릭하면 승무원이 노래를 부른다.
- 중립유닛을 50번쯤 클릭하면 핵 폭발 그래픽이 나오면서 죽는다. 싱글플레이에서만 가능하다.
- 테란의 영웅배틀크루저인 Hyperion과 Norad II 에디터 상에서 이름을 바꾸면 계급이 상승한다. (Hyperion의 경우 계급이 Captain Raynor이었고, Norad II의 경우 계급이 General Duke이다. 하지만 이름을 바꾸면 모두 Admiral로 계급이 올라간다. Alexei Stukov와 같은 계급이 되는 것이다.)
- Arcturus Mengsk와 Gerarad Dugalle을 에디터상에서 놓았을 때 공격력은 모두 Norad II의 공격력을 사용한다. (Norad II의 공격력을 바꾸면 그와 같이 바뀐다.)
- Aldaris를 에디터상에 놓고 게임을 실행하면 마법을 쓸 수 없다. (공격은 할 수 있고 에너지가 있지만 마법을 사용할 수 없다.)
- Gerard Dugalle(에디터 상에는 배틀크루저로 등장)를 에디터 상에 놓고 게임을 실행하면 계급이 Recruit(신병)으로나온다.
- 싱글플레이에서 자신의 종족이 저그일 경우, 'radio free zerg'라는 치트키를 쳐서 오버마인드의 랩을 들을 수 있다.
- 배틀크루저는 "너 자신을 알라"는 말을 한다.